Por desconhecer a Metodologia do Emprego Apoiado e suas possibilidades, muitas Organizações Sociais e Entidades Filantrópicas que atendem pessoas com deficiência ainda mantêm o modelo das Oficinas Protegidas que, metodologicamente, está em desuso por ser considerado pouco efetivo e segregativo.
O Emprego Apoiado, como uma Tecnologia Social, atende aos requisitos de fácil aplicabilidade, baixo custo e efetividade comprovada. O Instituto Jô Clemente, deste modo, tem assessorado estas organizações na implantação deste programa, qualificando seus profissionais, orientando a interação com as empresas e mesmo apontando os caminhos mais adequados para que o programa seja sustentável.
Para organizações, contudo, que não pretendem focar seus serviços na inclusão profissional, O Instituto Jô Clemente torna-se um recurso efetivo e sério para encaminhamento de pessoas atendidas quando chegado o momento da vida em que a inclusão profissional seja a solução mais adequada.